萌宠特工队之致命病毒剧情讲述睿智帅气的加拿大海归李峰、巧妙变装获取信息的美女姗姗、喜欢泡妞但内心善良的飞哥、精通黑客技术的贝儿、擅长狗语的小波，五人五色，共同组成萌宠特工队，帮助人类找寻丢失的爱犬。在找狗的过程中他们意外卷入了一起偷狗事件，五人开始追查幕后黑手。此时网上关于狗狗携带病毒的谣言正被广泛传播，养狗人士听信谣言纷纷弃狗。这正中了偷狗人的圈套，他们不费吹灰之力就可以在街上把狗拉走。
萌宠特工队一面需要紧急制止谣言，一面又需要抓捕幕后黑手。幕后黑手也巧设陷阱等待着特工队的到来。危机四起，病毒谣言如何破解?特工队能否识破陷阱，抓到幕后黑手?
